ก่อนหน้านี้แอปเปิลปล่อย iTunes 12.7 เพื่อรองรับ iOS 11 นั้นมีการเปลี่ยนแปลงหลักก็คือ การถอดคุณสมบัติการดาวน์โหลดหรือจัดการแอพ และริงโทนในอุปกรณ์ iOS ออกไปแบบไม่แจ้งผู้ใช้ล่วงหน้า ดูเหมือนว่าผู้ใช้จำนวนหนึ่งยังจำเป็นต้องการคุณสมบัตินี้อยู่ อย่างเช่นภาคองค์กรธุรกิจ แอปเปิลจึงหาทางออกด้วยการออก iTunes 12.6.3 ซึ่งเวอร์ชันนี้ สามารถลงทับกับ iTunes 12.7 ได้
ปกติแล้ว ถ้าติดตั้ง iTunes เวอร์ชันเก่ากว่าเวอร์ชันล่าสุด จะมีการแจ้งเตือนให้อัพเดตเวอร์ชันใหม่ และจะติดตั้งเวอร์ชันเก่าทับเวอร์ชันใหม่ไม่ได้ แต่สำหรับ iTunes 12.6.3 นั้นแอปเปิลเปิดทางให้ติดตั้งได้แม้ลง iTunes 12.7 ไปแล้วก็ตาม โดยเปิดให้ดาวน์โหลดใช้งานกันทั้ง Mac และ PC
ทั้งนี้ iTunes 12.6.3 เป็นเวอร์ชันสำหรับลูกค้าภาคองค์กรธุรกิจ (iTunes for Volume Purchasing Program) เพื่อให้ยังสามารถบริหารจัดการแอพ ในไอโฟน ไอแพด ไอพอดผ่าน iTunes ได้ต่อ และด้วยเป็นเวอร์ชัน VPP ดังนั้นจึงไม่มีบริการสนับสนุนทางเทคนิค
หมายเหตุ : iTunes 12.6.3 จึงไม่เหมาะกับการใช้งานบนคอมพิวเตอร์ส่วนตัว และ iTunes 12.6.3 จะไม่สามารถอ่าน library ของ iTunes 12.7 ได้ สำหรับผู้ใช้ทั่วไป ถ้าต้องการติดตั้งแอพผ่าน iTunes ก็ยังมีอีกวิธีคือ การดาวน์เกรดกลับไปใช้ iTunes 12.6
